要解锁稻妻海底遗迹，首先需要完成前置任务神樱大祓的荒海部分。该任务位于稻妻鸣神岛的荒海区域，玩家需找到荒海中间大树旁的三根雷柱，通过雷种子激活雷极跳跃至中间圆柱下方，进入地底空间。此处需按特定顺序点亮机关（前1、左3、左上2、右3、右上，完成神樱大祓的净化仪式。仪式结束后，右手边大门需解锁两个仙灵，一个在柱子上，另一个位于大祓树左侧，引导仙灵归位后即可开启下一层通道。
进入下一层后，需解决水位下降的机关谜题。该区域存在五个可旋转的机关方块，正确解法为击打中间方块两次，触发水位下降机制。水位退去后，海底遗迹的入口会显露出来。若水位未完全消退，需检查附近是否有遗漏的机关或未激活的雷种子结界。部分玩家可能忽略左侧房间的宝箱，但该宝箱与主线解谜无关，仅提供额外奖励。
海底遗迹的开启还依赖道具留念镜。玩家需在完成绀田村祭神奏上任务后获得该道具，用于观察地狐雕像。在荒海地底区域，需用留念镜照射三个隐藏的小狐狸雕像，触发墙上的机关按钮。全部激活后，海底遗迹的大门才会完全开启。若未携带留念镜，即使完成其他步骤也无法进入遗迹核心区域。
例如荒海水下锚点需通过雷立方机关解谜开启，解法为左侧击打两次、右侧击打两次。解锁锚点后可直接传送至遗迹附近，但需注意该锚点与遗迹开启无必然关联，仅为探索提供便利。若遗迹未出现，需回溯任务流程，确认神樱大祓的完成度及水位机关是否触发。
